Systems analysis reveals neuregulin-1 control of cardiomyocyte size and shape mediated by distinct PI3K and p38 pathways

Este estudio utiliza un enfoque de análisis de sistemas para demostrar que la neuregulina-1 regula el tamaño y la forma de los cardiomiocitos mediante vías de señalización PI3K y p38 distintas, ofreciendo nuevas perspectivas para el tratamiento selectivo de la remodelación cardíaca patológica.

Luanpaisanon, P., Ryall, K. A., Tan, P. M. + 7 more2026-03-12📄 systems biology

mRNA-Protein Coordination is Contextualized by Metastatic Biological Phenotypes

Este estudio demuestra que, en el contexto del cáncer metastásico, la coordinación entre ARNm y proteínas es matizada y contextual, donde la integración de ambas modalidades mejora la predicción del fenotipo al aprovechar tanto señales complementarias (proteómicas) como información consistente y sinérgica entre ambas capas moleculares.

Sharma, R., Meimetis, N., Begzati, A. + 3 more2026-03-11📄 systems biology

Blood Biochemical Responses to Acute Exercise: Findings from the Molecular Transducers of Physical Activity Consortium (MoTrPAC)

Este estudio del consorcio MoTrPAC identifica miles de cambios moleculares en sangre (transcriptos, proteínas y metabolitos) tras el ejercicio agudo, revelando tanto respuestas compartidas como específicas entre el ejercicio de resistencia y el de fuerza que ofrecen nuevas perspectivas sobre los mecanismos sistémicos de la actividad física.

Robbins, J. M., Katz, D. H., Many, G. + 16 more2026-03-11📄 systems biology

Trans-acting Determinants of Gene Expression: Effects of Transcription Factor Affinity, Abundance, and Localization

Este estudio demuestra que la fuerza de los sitios de unión en el promotor es el factor que más modula la expresión génica, seguido por la localización y la concentración de los factores de transcripción, mientras que las variaciones en la afinidad son principalmente amortiguadas, revelando así compensaciones de rendimiento entre estos determinantes trans y los elementos cis.

Lopez-Malo, M., Maerkl, S. J.2026-03-11📄 systems biology

Thymic selection of the T cell receptor repertoire is biased toward autoimmunity in females

El estudio revela que, aunque la diversidad general del repertorio de receptores de células T es similar entre sexos, la selección tímica en mujeres presenta un desequilibrio específico que favorece la supervivencia de células T efectoras autorreactivas y reduce la de células T reguladoras, lo que explica su mayor susceptibilidad a enfermedades autoinmunes.

Vantomme, H., Quiniou, V., Adda, L. + 15 more2026-03-10📄 systems biology

Phase-space distance between stationary states mudulates phenotypic plasticity in breast cancer

El estudio establece que la distancia en el espacio de fases entre estados estacionarios, junto con la estructura de bifurcación, determina la probabilidad y los tiempos de transición en redes regulatorias no conservativas, ofreciendo una explicación dinámica para la heterogeneidad y la sensibilidad de los subtipos de cáncer de mama.

Duarte de Araujo Caldas, M., de Assis Bento Lima, A., Lopes, F. J. P.2026-03-10📄 systems biology

Reconstructing biologically coherent cellular profiles from imaging-based spatial transcriptomics

El artículo presenta TRACER, una herramienta que mejora la asignación de transcritos a células en la transcriptómica espacial basada en imágenes mediante el uso de la coherencia génica y la co-localización espacial, permitiendo reconstruir perfiles celulares biológicamente coherentes y corregir errores de segmentación sin necesidad de anotaciones externas.

Yuan, L., Zheng, Y., Zhang, S. + 2 more2026-03-10📄 systems biology

Multi-omic responses to acute exercise in abdominal subcutaneous adipose tissue of sedentary adults: findings from MoTrPAC

El estudio MoTrPAC mapea las respuestas moleculares temporales y específicas del tipo de ejercicio en el tejido adiposo subcutáneo abdominal de adultos sedentarios mediante un enfoque multi-ómico, revelando programas distintos de remodelación y metabolismo que explican cómo el ejercicio agudo promueve la salud metabólica.

Ahn, C., Jin, C. A., Whytock, K. L. + 25 more2026-03-09📄 systems biology

Structured Schemas for LLM-Modeler Collaboration in Quantitative Systems Pharmacology Model Calibration

El marco MAPLE presenta un enfoque colaborativo entre modelos de lenguaje grandes y expertos humanos que utiliza esquemas estructurados y validadores automatizados para extraer y verificar datos de calibración de modelos de farmacología sistémica cuantitativa (QSP) a partir de la literatura, garantizando así la integridad, la trazabilidad y la reproducibilidad del proceso de calibración.

Eliason, J., Popel, A. S.2026-03-09📄 systems biology

Dynamic effects of fructose and Momordica charantia supplementation on pulmonary hypertension in broiler chickens

Este estudio demuestra que la suplementación a corto plazo con jarabe de maíz de alta fructosa y *Momordica charantia* reduce la severidad de la hipertensión pulmonar en pollos de engorde, validando además el uso de modelos de dinámica de sistemas para evaluar estrategias nutricionales en este modelo aviar.

Vargas-Villamil, L. M., Garcia Medina, A. D. C., Zaldivar Cruz, J. M. + 4 more2026-03-09📄 systems biology

Toroidal Search Algorithm: A Topology-Inspired Metaheuristic with Applications to ODE Parameterization in Mathematical Oncology

Este artículo presenta el Algoritmo de Búsqueda Toroidal (TSA), una nueva metaheurística inspirada en la topología del toro que elimina las limitaciones de los bordes y mejora la exploración en espacios de alta dimensión, demostrando un rendimiento superior en funciones de prueba y en la recuperación de parámetros para modelos de oncología matemática.

Oh, C., Wilkie, K. P.2026-03-07📄 systems biology